Na magistrálu sa napojíte v obci Kotešová, medzi Bytčou a Žilinou. Za pár kilmetrov doputujete do obce Vysoká nad Kysucou a následne do Makova, kde je križovatka cyklociest a môžete si vybrať viaceré varianty. Magistrála ďalej pokračuje do obce Korňa, kde stojí za návštevu Korňanský ropný prameň. Z prameňa vyviera ľahká ropa za doprovu príležitostného bublania a metánových výbuchov a je prírodnou pamiatkou už od roku 1984. Neďaleko prameňa sa nachádza aj ďalšia prírodná pamiatka Megonky, alebo tiež kamenné gule-pieskovkové útvary vajcovitého až guľovitého tvaru.
Následne vás čaká najnáročnejšia časť magistrály. Highlightom druhej polovice magistrály je výstup nad obec Čierne, odkiaľ je výborný výhľad na tvz. Trojmedzie, teda hranicu medzi Českom, Poľskom a Slovenskom. Z tohto miesta sa viete napojiť aj cyklotrasy vedúce do Poľska. Stúpania a klesania vás dovedú až do Oščadnice, kde môžete využiť reštauračné, či ubytovacie kapacity.
Kysucká cyklomagistrála ďalej pokračuje smerom na Novú a Starú Bystricu až do Kysuckej dediny, kde sa náchadza aj unikátna historická lesná úvraťová železnica. Stúpanie vás dovedie do sedla Demänová, kde táto cyklomagistrála končí. Dobrá správa je, že cesta pokračuje ďalej napojením na Oravskú cyklomagistrálu, ale o tom až nabudúce.